Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
APOC4-APOC2K7ER74 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.09□□□□□ -2.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.7 ms