Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SNX13Q9Y5W8 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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SNX13Q9Y5W8 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX13Q9Y5W8 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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