Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
LHX9Q9NQ69 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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