Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
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FOXQ1Q9C009 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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FOXQ1Q9C009 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
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FOXQ1Q9C009 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FOXQ1Q9C009 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
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