Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HERPUD2Q9BSE4 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
HERPUD2Q9BSE4 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms