Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CDO1Q16878 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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CDO1Q16878 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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CDO1Q16878 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDO1Q16878 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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