Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FXNQ16595 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FXNQ16595 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FXNQ16595 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
FXNQ16595 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
FXNQ16595 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FXNQ16595 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
FXNQ16595 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FXNQ16595 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FXNQ16595 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FXNQ16595 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FXNQ16595 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FXNQ16595 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FXNQ16595 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FXNQ16595 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
FXNQ16595 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FXNQ16595 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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