Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GABRA6Q16445 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
GABRA6Q16445 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms