Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.73
TRIP4Q15650 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TRIP4Q15650 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms