Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
TAF1CQ15572 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms