Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
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SIX1Q15475 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SIX1Q15475 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SIX1Q15475 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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