Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SEC23BQ15437 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SEC23BQ15437 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms