Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
TTF1Q15361 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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