Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PCOLCEQ15113 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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