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| BRD3 | Q15059 | LEPR-202 | ENST00000349533 | 8227 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| BRD3 | Q15059 | LTN1-201 | ENST00000361371 | 7685 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| BRD3 | Q15059 | CACNB4-238 | ENST00000636901 | 7706 nt | TSL 5 BASIC | 2.97 | □□□□□ -1.93 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC009541.1-201 | ENST00000438279 | 2662 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.93 | | |
| BRD3 | Q15059 | RMDN2-203 | ENST00000402091 | 1973 nt | TSL 2 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA25B-201 | ENST00000365507 | 128 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-142P-201 | ENST00000384019 | 107 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
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| BRD3 | Q15059 | SNORA11.1-201 | ENST00000408133 | 129 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL445259.1-203 | ENST00000427828 | 251 nt | TSL 3 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
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| BRD3 | Q15059 | LYRM2-203 | ENST00000520318 | 677 nt | TSL 2 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC005909.1-201 | ENST00000577835 | 755 nt | TSL 3 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC063943.3-201 | ENST00000615562 | 356 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC010722.1-201 | ENST00000622595 | 582 nt | TSL 5 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | COMMD6-213 | ENST00000626103 | 120 nt | TSL 5 BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA43.4-201 | ENST00000629559 | 138 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF280C-201 | ENST00000370978 | 4634 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC069528.2-201 | ENST00000624849 | 1991 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZBTB26-202 | ENST00000373656 | 4443 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092593.1-201 | ENST00000515413 | 1815 nt | BASIC | 2.96 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | ARHGAP5-202 | ENST00000345122 | 9604 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR26A1-201 | ENST00000362205 | 77 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU4-15P-201 | ENST00000362613 | 141 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-562P-201 | ENST00000362731 | 107 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.212-201 | ENST00000364177 | 102 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.248-201 | ENST00000364501 | 109 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| BRD3 | Q15059 | GSTA3-202 | ENST00000370968 | 775 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA32.2-201 | ENST00000384049 | 122 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-933P-201 | ENST00000384424 | 107 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-95P-201 | ENST00000384697 | 107 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC079150.1-201 | ENST00000413043 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AL645568.3-201 | ENST00000433683 | 316 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
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| BRD3 | Q15059 | GPM6BP3-201 | ENST00000442797 | 145 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-864P-201 | ENST00000516256 | 108 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-358P-201 | ENST00000516564 | 75 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC008083.3-201 | ENST00000547777 | 329 nt | TSL 3 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007598.1-202 | ENST00000561528 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | CPDP1-201 | ENST00000579660 | 283 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL450472.1-202 | ENST00000637286 | 180 nt | BASIC | 2.95 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | TCF12-203 | ENST00000343827 | 3956 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | PHTF2-202 | ENST00000275575 | 4541 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | PRKACB-207 | ENST00000394838 | 4294 nt | TSL 5 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | DEUP1-201 | ENST00000298050 | 2664 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.86-201 | ENST00000363020 | 111 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNA5SP393-201 | ENST00000363423 | 117 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA9.2-201 | ENST00000365361 | 133 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-831P-201 | ENST00000384548 | 107 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL138885.1-201 | ENST00000405921 | 675 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | Y_RNA.597-201 | ENST00000410463 | 100 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL139109.1-201 | ENST00000455491 | 297 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC083906.5-201 | ENST00000503722 | 328 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | LNX1-AS1-202 | ENST00000510785 | 550 nt | TSL 2 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | CYCSP26-201 | ENST00000534107 | 320 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC018630.3-201 | ENST00000542637 | 96 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC007347.1-201 | ENST00000563879 | 281 nt | TSL 3 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092070.3-201 | ENST00000596041 | 337 nt | TSL 3 BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC078795.3-201 | ENST00000602913 | 472 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL078605.1-201 | ENST00000603529 | 500 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL133215.3-201 | ENST00000609801 | 448 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC093913.1-201 | ENST00000614178 | 329 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | DLEU1_1.1-201 | ENST00000618107 | 190 nt | BASIC | 2.94 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | GCNT4-201 | ENST00000322348 | 5554 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | CAPS2-203 | ENST00000393284 | 3430 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RGS18-201 | ENST00000367460 | 2150 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU1-91P-201 | ENST00000364746 | 163 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-546P-201 | ENST00000383991 | 107 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR128-1-201 | ENST00000384921 | 82 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | SNORA48.2-201 | ENST00000390926 | 124 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU2-32P-201 | ENST00000411193 | 191 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RPL30P16-201 | ENST00000419341 | 429 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | MTND1P11-201 | ENST00000456661 | 876 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC104564.1-201 | ENST00000493028 | 407 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC145146.1-201 | ENST00000496370 | 254 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-273P-201 | ENST00000516937 | 96 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC107953.1-201 | ENST00000522216 | 297 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC022080.3-201 | ENST00000544433 | 482 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
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| BRD3 | Q15059 | MIR3200-201 | ENST00000580767 | 85 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | ZNF616-202 | ENST00000596290 | 568 nt | TSL 4 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | BNIP3P10-201 | ENST00000605360 | 577 nt | BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | FAM214A-204 | ENST00000546305 | 3697 nt | TSL 2 BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | ENAM-201 | ENST00000396073 | 5679 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.93 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC108750.1-201 | ENST00000637986 | 2706 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |
| BRD3 | Q15059 | WWP1-201 | ENST00000265428 | 3362 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.92 | □□□□□ -1.94 | | |