Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
BRD3Q15059 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
BRD3Q15059 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193.3 ms