Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
KARSQ15046 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
KARSQ15046 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
KARSQ15046 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
KARSQ15046 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
KARSQ15046 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
KARSQ15046 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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