Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC100814.1-201ENST00000606963 623 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMCO1Q147U7 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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