Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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GBX1Q14549 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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GBX1Q14549 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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GBX1Q14549 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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GBX1Q14549 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
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GBX1Q14549 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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GBX1Q14549 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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GBX1Q14549 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
GBX1Q14549 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
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