Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
UBE4AQ14139 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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UBE4AQ14139 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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UBE4AQ14139 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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UBE4AQ14139 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
UBE4AQ14139 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
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