Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCARB2Q14108 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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