Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
DDX39BQ13838 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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