Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
ITGB3BPQ13352 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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ITGB3BPQ13352 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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ITGB3BPQ13352 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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ITGB3BPQ13352 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.82□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
ITGB3BPQ13352 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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