Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CLN3Q13286 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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