Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
MRPL28Q13084 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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