Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
HOXC5Q00444 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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