Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PTPRDP23468 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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