Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USP43Q70EL4 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms