Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
IMPG1Q17R60 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IMPG1Q17R60 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IMPG1Q17R60 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IMPG1Q17R60 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IMPG1Q17R60 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IMPG1Q17R60 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IMPG1Q17R60 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC0.84□□□□□ -2.27
IMPG1Q17R60 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IMPG1Q17R60 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IMPG1Q17R60 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
IMPG1Q17R60 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 HMGN2P9-201ENST00000476875 229 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC0.78□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
IMPG1Q17R60 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.8 ms