Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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PTPROQ16827 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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PTPROQ16827 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPROQ16827 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPROQ16827 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPROQ16827 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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PTPROQ16827 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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PTPROQ16827 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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PTPROQ16827 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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PTPROQ16827 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
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PTPROQ16827 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
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PTPROQ16827 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPROQ16827 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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