Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CDKN3Q16667 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CDKN3Q16667 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms