Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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SGCAQ16586 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCAQ16586 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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