Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC107401.1-201ENST00000503426 685 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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SGCBQ16585 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SGCBQ16585 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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