Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CHRNA6Q15825 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CHRNA6Q15825 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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