Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SMCO1Q147U7 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
SMCO1Q147U7 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.7 ms