| SEMA3A | Q14563 | PRKACB-219 | ENST00000614872 | 4306 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.91 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LEPR-202 | ENST00000349533 | 8227 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CDK1-209 | ENST00000614696 | 1884 nt | TSL 5 BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FILIP1L-206 | ENST00000471562 | 2854 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.09 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | E2F5-208 | ENST00000521429 | 1551 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC138393.1-203 | ENST00000327086 | 343 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-778P-201 | ENST00000363269 | 103 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORD14B-201 | ENST00000364533 | 90 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR483-201 | ENST00000385070 | 76 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL21P3-201 | ENST00000395517 | 478 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR1302-3-201 | ENST00000408128 | 138 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | RN7SKP58-201 | ENST00000411010 | 305 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL592148.1-201 | ENST00000413568 | 445 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MRLN-201 | ENST00000414264 | 422 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL160162.1-202 | ENST00000417654 | 244 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC008267.5-201 | ENST00000424928 | 265 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TTTY8-202 | ENST00000426035 | 518 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC007566.1-201 | ENST00000427458 | 643 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC093151.1-201 | ENST00000427711 | 313 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL590999.1-206 | ENST00000437947 | 436 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TTTY8B-202 | ENST00000455570 | 518 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC146507.2-201 | ENST00000460608 | 476 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RN7SL20P-201 | ENST00000488827 | 297 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | SNORA25.10-201 | ENST00000515926 | 124 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1183P-201 | ENST00000517054 | 60 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-794P-201 | ENST00000517261 | 64 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC008115.2-201 | ENST00000539988 | 241 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092747.1-202 | ENST00000540595 | 380 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC025423.5-201 | ENST00000550230 | 219 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | H3F3AP1-201 | ENST00000559984 | 334 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC113195.1-201 | ENST00000579952 | 141 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL683887.1-201 | ENST00000603401 | 287 nt | TSL 3 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL137843.1-201 | ENST00000605078 | 385 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTND4LP5-201 | ENST00000605152 | 292 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR663AHG-231 | ENST00000609044 | 590 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | U4.1-201 | ENST00000620349 | 87 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | KCNIP4-IT1-201 | ENST00000627566 | 9848 nt | BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NEB-220 | ENST00000618972 | 26307 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FGF14-201 | ENST00000376131 | 12882 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ACTR6-212 | ENST00000552376 | 1659 nt | TSL 5 BASIC | 3.08 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZBED5-201 | ENST00000413761 | 2512 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL161668.1-201 | ENST00000320322 | 358 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC073325.2-201 | ENST00000339545 | 159 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-450P-201 | ENST00000364654 | 107 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-593P-201 | ENST00000364716 | 112 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1180P-201 | ENST00000364935 | 107 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC117470.1-201 | ENST00000381974 | 330 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-842P-201 | ENST00000384269 | 107 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA46-201 | ENST00000384762 | 135 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU2-25P-201 | ENST00000411041 | 191 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC096644.2-201 | ENST00000429278 | 159 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | USP9YP16-201 | ENST00000430287 | 407 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNAP23P1-201 | ENST00000433229 | 246 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC006026.2-201 | ENST00000457376 | 180 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SEM1P1-201 | ENST00000506694 | 209 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC01256-201 | ENST00000513270 | 508 nt | TSL 2 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-470P-201 | ENST00000515954 | 104 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.708-201 | ENST00000516950 | 96 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC026371.1-201 | ENST00000551867 | 419 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC023906.2-201 | ENST00000558343 | 462 nt | TSL 3 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC011477.3-201 | ENST00000585571 | 403 nt | TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC011494.1-201 | ENST00000596454 | 237 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC012468.1-201 | ENST00000604888 | 430 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ADARB1-213 | ENST00000611195 | 159 nt | TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | U2.21-201 | ENST00000637295 | 81 nt | BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZBBX-201 | ENST00000307529 | 3071 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZBBX-204 | ENST00000392767 | 3071 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NBPF20-202 | ENST00000392971 | 18450 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZCCHC10-201 | ENST00000324170 | 2178 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNX10-209 | ENST00000619420 | 2361 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 3.07 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PPIP5K2-203 | ENST00000414217 | 5842 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | GABRG2-221 | ENST00000639683 | 3600 nt | TSL 5 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIER3-203 | ENST00000381213 | 5198 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-238P-201 | ENST00000363313 | 106 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.149-201 | ENST00000363558 | 117 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-384P-201 | ENST00000364900 | 104 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA54-201 | ENST00000384281 | 123 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORD15B-201 | ENST00000384714 | 146 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR627-201 | ENST00000384979 | 97 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR34B-201 | ENST00000385076 | 84 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR767-201 | ENST00000390228 | 109 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091812.1-201 | ENST00000432235 | 1948 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC092573.2-202 | ENST00000437243 | 336 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC018495.1-201 | ENST00000440266 | 452 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | BX510359.1-201 | ENST00000456973 | 237 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC117465.1-201 | ENST00000457125 | 522 nt | TSL 3 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU7-187P-201 | ENST00000458985 | 68 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC010655.3-201 | ENST00000478818 | 450 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC108516.1-201 | ENST00000503666 | 257 nt | TSL 2 BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC022493.2-201 | ENST00000506122 | 481 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC113155.1-201 | ENST00000511141 | 769 nt | BASIC | 3.06 | □□□□□ -1.92 | | |