Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEDD9Q14511 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms