Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
SPIDRQ14159 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.7 ms