Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CUL4AQ13619 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
CUL4AQ13619 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL4AQ13619 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.53□□□□□ -2
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