Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PRPF4BQ13523 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PRPF4BQ13523 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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