Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SF3B2Q13435 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SF3B2Q13435 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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