Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
MSLNQ13421 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
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