Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
SKP2Q13309 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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SKP2Q13309 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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SKP2Q13309 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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SKP2Q13309 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SKP2Q13309 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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