Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TRIM28Q13263 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TRIM28Q13263 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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