Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms