Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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RPA4Q13156 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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RPA4Q13156 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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RPA4Q13156 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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RPA4Q13156 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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RPA4Q13156 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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RPA4Q13156 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
RPA4Q13156 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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