Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC0.27□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PRDM2Q13029 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
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