Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK2Q13002 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms