Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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HOXC5Q00444 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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HOXC5Q00444 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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HOXC5Q00444 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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HOXC5Q00444 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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HOXC5Q00444 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
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HOXC5Q00444 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
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HOXC5Q00444 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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HOXC5Q00444 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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HOXC5Q00444 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
HOXC5Q00444 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
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