Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPREP23469 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPREP23469 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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