Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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